NI PXI及LabVIEW的磁振成像系統(tǒng)在診斷嬰兒腦活動的應用
出處:Christopher G. Atwood 發(fā)布于:2011-08-24 18:51:40
開發(fā)非侵入式的磁振成像系統(tǒng),在時間和空間上繪制嬰兒可能出現(xiàn)大腦癱瘓及癲癇癥狀時腦活動所產(chǎn)生的磁場,從而能夠在早期實施醫(yī)療介入。創(chuàng)建適應性強的高速多通道NI PXI數(shù)據(jù)采集系統(tǒng),通過NI MXI-3總線將實時數(shù)據(jù)傳輸?shù)?a target="_blank">遠程控制器,采用基于NI LabVIEW的軟件進行數(shù)據(jù)處理。"現(xiàn)在,我們的用戶擁有了一臺便宜的磁振成像系統(tǒng),可迅速用于嬰兒的臨床實驗及醫(yī)院診療。"
PXI (PCI eXtensions for Instrumentation,面向儀器系統(tǒng)的PCI擴展) 是一種由NI公司發(fā)布的堅固的基于PC的測量和自動化平臺。PXI結合了PCI的電氣總線特性與CompactPCI的堅固性、模塊化及Eurocard機械封裝的特性發(fā)展成適合于試驗、測量與數(shù)據(jù)采集場合應用的機械、電氣和軟件規(guī)范。制訂PXI規(guī)范的目的是為了將臺式PC的性能價格比優(yōu)勢與PCI總線面向儀器領域的必要擴展完美地結合起來,形成一種主流的虛擬儀器測試平臺。這使它成為測量和自動化系統(tǒng)的高性能、低成本運載平臺。
挑戰(zhàn)腦部成像
腦部活動涉及復雜的電流模式,電流流過腦部的神經(jīng),迅速在不同大腦區(qū)域內移動,并隨時間變化。這些電流產(chǎn)生極微弱的磁場,僅數(shù)十個毫微微特斯拉,比地球磁場弱10個數(shù)量級。我們受一位世界著名的學者委托,設計一臺能夠在磁干擾極大的醫(yī)院環(huán)境下測量 并繪制這些微小磁場的機器。目前現(xiàn)有的技術都很難解決該難題。我們采用超導量子干涉儀(SQUID)來設計該系統(tǒng),它具有極高的磁場靈敏度,從而能夠達到原型要求的傳感能力
一家制造人腦成像設備的制造商提出要求用50萬美元建造具有多層屏蔽合金墻的房間,如果采用C語言編程,需要6個編程人員超過10年的工作量才能實現(xiàn)。用LabVIEW能夠實現(xiàn)同樣的數(shù)據(jù)處理、數(shù)據(jù)顯示及更多其它功能,只需一個未經(jīng)正式軟件開發(fā)培訓的工程師不到1年的時間即可完成。我們接受挑戰(zhàn),因為我們相信LabVIEW的能力以及易用的NI硬件配置。
可輕松配置的NI硬件
我們的機械工程師搭建了一個嬰兒尺寸的頭托,可容納將近100個SQUID傳感器,通過液態(tài)氦冷卻,并由真空隔離。傳感器上的模擬信號輸送到PXI 機箱中的NI高速24位數(shù)據(jù)采集設備(NI PXI-4472 DSA)。我們采用PXI 機箱中的背板總線傳輸所有通道間的同步采集數(shù)據(jù),這對于成功繪制腦活動圖非常關鍵。采集到的數(shù)據(jù)被連續(xù)寫入存儲器,通過光纖MXI-3總線進行直接存儲器讀取,在遠程計算機上實現(xiàn)數(shù)據(jù)處理。我們采用ni.com上的共享來配置軟硬件,僅用大約數(shù)分鐘時間即可實現(xiàn)基本采集功能。
LabVIEW庫節(jié)省開發(fā)時間
LabVIEW是一種程序開發(fā)環(huán)境,由美國國家儀器(NI)公司研制開發(fā)的,類似于C和BASIC開發(fā)環(huán)境,但是LabVIEW與其他計算機語言的顯著區(qū)別是:其他計算機語言都是采用基于文本的語言產(chǎn)生代碼,而LabVIEW使用的是圖形化編輯語言G編寫程序,產(chǎn)生的程序是框圖的形式。隨著計算機功能的日益強大以及其體積的日趨縮小,這類儀器功能也越來越強大,目前已經(jīng)出現(xiàn)含嵌入式系統(tǒng)的儀器。另一種方式是將儀器裝入計算機。以通用的計算機硬件及操作系統(tǒng)為依托,實現(xiàn)各種儀器功能。虛擬儀器主要是指這種方式。上面的框圖反映了常見的虛擬儀器方案。
系統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理及數(shù)據(jù)顯示依賴于靈活的研究模型,現(xiàn)在卻需要盡量簡化以備臨床使用。LabVIEW使之成為可能。我們采用LabVIEW自帶的豐富矩陣函數(shù)庫編寫了噪聲抑制算法,并使用了NI信號處理工具集中的功能。通過詳細的文檔及大量,快速完成了軟件開發(fā)。我們還在軟件中直接集成了已有的圖形化工具,實現(xiàn)常用的數(shù)字濾波、小波設計、聯(lián)合時頻域分析。綜合以上所有軟件組件,我們消除了通道間的信號相關性。此外,我們實現(xiàn)了對重復刺激信號的同步平均。所有這些功能極大的降低了噪聲水平,從而使我們能夠直接獲得腦部信號。
LabVIEW代碼的高效性
我們希望能在數(shù)據(jù)采集的同時處理并顯示數(shù)據(jù),讓醫(yī)生可以通過調整頭部位置,或調整刺激的種類(如皮膚表面的氣鼓或聲波模式),進而影響腦活動,實現(xiàn)一系列測量。這就要求極高的數(shù)據(jù)處理速度,但我們發(fā)現(xiàn),只要注重LabVIEW代碼的效率問題,采用商用雙Xeon 2.6 GHz機器就能滿足需求。原始數(shù)據(jù)也可同時傳輸?shù)酱疟P,軟件的設計使得醫(yī)生可通過簡單調節(jié)旋鈕將輸入數(shù)據(jù)源選擇為來自PXI機箱的實時數(shù)據(jù)、保存至文件的原始數(shù)據(jù)、計算后的仿真數(shù)據(jù)。不同數(shù)據(jù)源的數(shù)據(jù)以同樣的方式輸入軟件,通過噪聲抑制算法,并終顯示。此外,同樣的軟件還能在任意桌面PC上安裝,為醫(yī)生進行數(shù)據(jù)分析提供便利,從而用戶也無需為此去學習不同的軟件包使用方法。
LabVIEW圖表功能的靈活性
我們采用了LabVIEW圖表組件。舉例來說,我們采用了:
標簽中的子面板,使用戶能夠快速地在多個顯示間切換,將圖表置于獨立可調整大小的窗口中,并可任意裁剪,從而保證顯示的條理性和靈活性。
標簽下多種不同的圖表類型,凸顯不同的數(shù)據(jù)。
3D圖表以準實時的方式同時顯示頭部及傳感器。通過光學方法檢測嬰兒頭部在頭托傳感器陣列中的自然移動,由 LabVIEW軟件計算并繪制頭部相關于傳感器的位置,并對移動進行補償。
3D圖表用于顯示準實時的陣列計算。
動態(tài)加載分析 VI,用戶可自行編寫算法以及顯示,并自由調用(用于主程序運行中的代碼編輯,或用于快速測試及評估)。
例行分析工具庫加載簡化系統(tǒng)在臨床中的使用。
2004年11月14日下午7:44,我們見證了世界上個無屏蔽的嬰兒腦磁信號。我們成功了。
成像系統(tǒng)的未來
我們計劃開發(fā)相關的多通道數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)。使用NI PXI硬件我們可以根據(jù)需要拓展或減少通道數(shù)量。LabVIEW可使我們自由地將軟件移植到其它操作系統(tǒng)上,并可輕松將本地語言顯示轉化為其它語言,F(xiàn)在,我們的用戶能夠擁有一臺便宜的磁振成像系統(tǒng),可迅速用于嬰兒的臨床試驗及醫(yī)院診療。他希望系統(tǒng)能夠直接評估藥物的功效,并輔助外科手術定位。
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